Quando a locução faz referência a pessoa, pese fica invariável e rege a preposição a.

Em que pese aos líderes da oposição, a criação da CPI foi rejeitada.

Quando faz referência a coisa, o verbo concorda com o sujeito e dispensa a preposição.

Em que pesem as justificativas da oposição, os senadores rejeitaram a criação da CPI.

Em que pese (em que pesem) os esforços que estão sendo feitos no nosso país, a questão da falta de água tem se agravado — disse o parlamentar.